Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20828J3KMI7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Gm20828J3KMI7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Gm20828J3KMI7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Gm20828J3KMI7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Gm20828J3KMI7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Gm20828J3KMI7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20828J3KMI7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Gm20828J3KMI7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Gm20828J3KMI7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20828J3KMI7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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