Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20815J3KMI0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20815J3KMI0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms