Protein–RNA interactions for Protein: H3BJD6

Ppp1r9a, Protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 9A, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r9aH3BJD6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r9aH3BJD6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp1r9aH3BJD6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r9aH3BJD6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r9aH3BJD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms