Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Taf4bG5E8Z2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf4bG5E8Z2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf4bG5E8Z2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms