Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2b1G5E829 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp2b1G5E829 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b1G5E829 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b1G5E829 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms