Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
2210016F16RikG3X8U3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
2210016F16RikG3X8U3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms