Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NpcdF8VQB8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NpcdF8VQB8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NpcdF8VQB8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms