Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh11xF6ZNL5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh11xF6ZNL5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcdh11xF6ZNL5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdh11xF6ZNL5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdh11xF6ZNL5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcdh11xF6ZNL5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcdh11xF6ZNL5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdh11xF6ZNL5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdh11xF6ZNL5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms