Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm8220F6YKI2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8220F6YKI2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8220F6YKI2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms