Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm8444F6XS56 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm8444F6XS56 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm8444F6XS56 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms