Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21977F6U3N7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21977F6U3N7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21977F6U3N7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms