Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc146E9Q9F7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc146E9Q9F7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc146E9Q9F7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms