Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Vmn2r35E9Q7U8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn2r35E9Q7U8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r35E9Q7U8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms