Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Col22a1E9Q7P1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col22a1E9Q7P1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col22a1E9Q7P1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms