Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20518E9Q548 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20518E9Q548 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20518E9Q548 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms