Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
2010300C02RikE9Q3M9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
2010300C02RikE9Q3M9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
2010300C02RikE9Q3M9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms