Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc62E9PVD1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc62E9PVD1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc62E9PVD1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms