Protein–RNA interactions for Protein: E9PUB3

Gm5878, Predicted gene 5878, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5878E9PUB3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5878E9PUB3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5878E9PUB3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms