Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Piezo1E2JF22 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Piezo1E2JF22 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Piezo1E2JF22 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms