Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc13D3YV10 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc13D3YV10 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc13D3YV10 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms