Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700015F17RikD3YUK8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
1700015F17RikD3YUK8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms