Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptprz1B9EKR1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptprz1B9EKR1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptprz1B9EKR1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptprz1B9EKR1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms