Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmf1B9EKI3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tmf1B9EKI3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmf1B9EKI3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Tmf1B9EKI3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms