Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clip3B9EHT4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clip3B9EHT4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip3B9EHT4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clip3B9EHT4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip3B9EHT4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip3B9EHT4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip3B9EHT4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clip3B9EHT4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms