Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfap58B2RW38 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cfap58B2RW38 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfap58B2RW38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfap58B2RW38 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms