Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrn3B2RS91 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrn3B2RS91 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrn3B2RS91 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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