Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp42B2RQC2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp42B2RQC2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp42B2RQC2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp42B2RQC2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms