Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-M5A7VMS3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M5A7VMS3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M5A7VMS3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms