Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm6880A3KG45 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm6880A3KG45 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Gm6880A3KG45 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Gm6880A3KG45 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm6880A3KG45 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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