Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef6A2A8M8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef6A2A8M8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef6A2A8M8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef6A2A8M8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef6A2A8M8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef6A2A8M8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pramef6A2A8M8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef6A2A8M8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef6A2A8M8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pramef6A2A8M8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms