Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc1lA2A5N3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc1lA2A5N3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pabpc1lA2A5N3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms