Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv30A0A0B4J1P1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv30A0A0B4J1P1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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