Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Larp1bA0A0A6YXJ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms