Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm3238W4VSP7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3238W4VSP7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm3238W4VSP7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm3238W4VSP7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm3238W4VSP7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3238W4VSP7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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