Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5538W4VSP6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5538W4VSP6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5538W4VSP6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5538W4VSP6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5538W4VSP6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5538W4VSP6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5538W4VSP6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5538W4VSP6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5538W4VSP6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5538W4VSP6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5538W4VSP6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5538W4VSP6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5538W4VSP6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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