Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cib2Q9Z309 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cib2Q9Z309 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cib2Q9Z309 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cib2Q9Z309 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cib2Q9Z309 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cib2Q9Z309 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms