Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme3Q9WV85 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme3Q9WV85 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nme3Q9WV85 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme3Q9WV85 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme3Q9WV85 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme3Q9WV85 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme3Q9WV85 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme3Q9WV85 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme3Q9WV85 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme3Q9WV85 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme3Q9WV85 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme3Q9WV85 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms