Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabbr1Q9WV18 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gabbr1Q9WV18 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabbr1Q9WV18 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.2 ms