Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6cQ9WTM3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6cQ9WTM3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6cQ9WTM3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms