Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3Q9QZS0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a3Q9QZS0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a3Q9QZS0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms