Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc3Q9QZC1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trpc3Q9QZC1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms