Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Bcl11aQ9QYE3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bcl11aQ9QYE3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bcl11aQ9QYE3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11aQ9QYE3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms