Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snai3Q9QY31 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms