Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY24

Zbp1, Z-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbp1Q9QY24 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbp1Q9QY24 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zbp1Q9QY24 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbp1Q9QY24 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms