Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpc5Q9QX29 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trpc5Q9QX29 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trpc5Q9QX29 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpc5Q9QX29 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpc5Q9QX29 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms