Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt17Q9QWL7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt17Q9QWL7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt17Q9QWL7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms