Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rai2Q9QVY8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rai2Q9QVY8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rai2Q9QVY8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rai2Q9QVY8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms