Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Csnk1eQ9JMK2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Csnk1eQ9JMK2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk1eQ9JMK2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms