Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AatfQ9JKX4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AatfQ9JKX4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms