Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco1Q9JJS6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco1Q9JJS6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco1Q9JJS6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bco1Q9JJS6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bco1Q9JJS6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bco1Q9JJS6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
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